pva48, битрейт для лосслесс ничего не значит, и ничего кроме как средней степени сжатия относительно оригинальных PCM-данных не показывает. Любое преобразование лосслесс между собой происходит без потери информации в случае, если не происходит никакой сторонней обработки (понижения/повышения частоты, битности, нормализации звука или каких-то других манипуляций)
Установите компонент
File Integrity Verifier, после перезагрузки плеера в контекстном меню появится опция Utilities -> Verify integrity. С помощью ее можно вычислить контрольные суммы аудио-данных в lossless-файлах. Проверьте - если для исходного и полученного файла они одинаковые, то потерь в аудиоданных не произошло, если же отличаются, значит в конвертере на вкладках Output Format или Processing что-то лишнее.