Так. Насчёт "command": доступны только команды из контекстного меню (НЕ из меню плеера), поэтому если хотите управлять воспроизведением, прописывайте в foo_run что-нибудь типа "foobar2000 /play" и пишите название пресета.
Кстати, вот доступные команды:
Available switches:
/add, /play, /pause, /playpause, /prev, /next, /rand, /stop, /exit, /show, /hide, /config
/command:, /playlist_command:, /playing_command: